1960年,从沈阳军区司令转业到四川担任副省长的邓华,正式走马上任。
对于地方工作,他没有任何经验,虽然希望继续留在军队,但情况不允许,到地方重新开始。
邓华的职务虽然降低,其他待遇并没有变动,依旧是八大中央委员,行政5级待遇,配备秘书、公务员和司机等。

他在四川的工作是有目共睹的,上级知道他对农机工作不了解,表示可以先有一段时间磨合期。他不希望坐以待毙,更喜欢主动工作,买来农机相关书籍,走遍四川二百多个县乡,掌握一手资料,作为西南局第一书记李井泉对他的工作态度很认可。
李井泉与邓华资历差不多,如果他不转业地方也是上将级别,转入地方行政5级。不过,他的职务提拔很快,1958年增补为政治局委员,进入决策层机构。
1962年,七千人大会后,上级下达一个文件《关于加速进行党员、干部甄别工作的通知》,李井泉登门拜访,对他说:对给你的处分有什么意见和要求,可以谈,可以替你向上级反映。邓华思虑再三表示:没意见。

在很多人看来,他的问题应该被甄别平反,希望他能把握时机。
他当然希望能得到解决,而且事情过去2年,因此准备给中央写一个报告,希望上级给他一个书面结论。可他写后并没有上交,而是反复思考,最终没有交出去。因为他清楚知道问题根源所在,自己的问题解决不了。
没多久,召开八届十中全会,他作为委员参加,也被区别对待。
在会议期间,老战友刘亚楼、陶铸都来看望他,知道他身体不好,建议他到广州疗养。陈老总遇到他听,也希望他到医院治疗,对于大家的关系,他真正感到温暖。

实际上,他的身体确实很长,从北京开会回去,就因肺气肿和甲状腺功能亢进症而住院,身体从120斤降到七十多斤。在医院1年多,身体才算恢复一些。
他有肺气肿是老毛病了,在1947年东北战场上打冬季攻势时,就因为肺气肿而无法指挥部队 ,到哈尔滨前疗养,部队由副司令指挥。那时候年轻,身体还算扛住,如今是身体病症,工作忙碌加上精神打击等诸多原因,身体垮的厉害。
1977年,他重返军队后,要希望保养好身体,继续为军队工作。可身体实在太差,主要以休养为主。这一年才67岁,年龄说大也不大,跟他差不多的上将许世友、王平、杨得志、张爱萍都在一线位置上发挥作用。转眼到1980年,身体病情加重而故去。