软著电子版权和软件著作权在多个方面存在区别，具体如下：
一、定义与保护对象软著电子版权：是电子版权认证联合服务平台基于区块链技术提供电子版权认证服务，为APP或小程序上架应用市场的有力版权证明。其保护对象通常限于APP或小程序软件，且发证机构为北京数字认证旗下公司颁发，非国家行政单位颁发。
软件著作权：是指软件的开发者或者其他权利人依据有关著作权法律的规定，对于软件作品所享有的各项专有权利。其保护对象是计算机软件，包括源程序和文档在内的一切与软件相关的内容，发证机构为国家版权中心。
二、作用与适用范围软著电子版权：
主要用于APP或小程序上架应用市场，认可度基本覆盖主流应用市场。
目前主要支持抖音平台的小程序上架，微信、支付宝等平台暂不支持。
法律作用有限，通常不可作为维权依据。
软件著作权：
所有软件均可申请，不仅限于APP或小程序。
是APP、小程序上架应用市场或平台使用的有力证明。
可作为申请项目补贴加分项（如高企、双软等）、职称考评加分项、学生加学分评奖学金、考研等加分项。
可用于维权使用，是企业无形资产。
三、登记流程与要求软著电子版权：登记流程相对简便，通常重点在于作品的提交和相关权利声明。办理周期较短，从1个工作日到15个工作日不等，根据加急服务的不同，办理成本也有所不同。
软件著作权：登记流程相对复杂，需要提供更多技术方面的资料，如软件的操作手册、源程序代码等。办理周期较长，普通登记的办理周期约为3~8个月，加急登记则在60日内完成。
四、法律保护与效力软著电子版权：由于发证机构非国家行政单位，且法律作用有限，因此在维权时可能面临一定困难。
软件著作权：由国家版权中心颁发，具有更高的法律效力和保护力度。在发生侵权纠纷时，软件著作权人可以依法维护自己的权益。
