根据《联合国海洋法公约》及相关国际法规定，国外军舰若要无害通过沿海国领海，不能损害沿海国的和平、良好秩序或安全，不得进行《公约》第 19 条列举的有害活动，如对沿海国的主权、领土完整或政治独立进行武力威胁或使用武力，以任何种类的武器进行操练或演习，搜集情报使沿海国的防务或安全受损害，进行影响沿海国防务或安全的宣传，在船上起落或接载任何飞机，在船上发射、降落或接载任何军事装置，违反沿海国海关、财政、移民或卫生的法律和规章上下任何商品、货币或人员，进行故意和严重的污染行为，从事捕鱼活动，进行研究或测量活动，干扰沿海国任何通讯系统或其他设施或设备，以及进行与通过没有直接关系的其他活动。
在国际法的理论和实践上，一般认为外国军舰通过领海应当事先征得沿海国的同意。不同国家可能根据自身法律和政策对外国军舰无害通过作出具体规定，如《中华人民共和国领海及毗连区法》规定，外国军用船舶进入中华人民共和国领海，须经中华人民共和国政府批准。
军舰通过领海的航行应是穿过领海但不进入内水或停靠内水以外的泊船处或港口设施，或驶往或驶出内水或停靠这种泊船处或港口设施，且应继续不停和迅速进行，除非受到不可抗力或遇难或为救助人员、船舶或飞机的目的而停止。在领海内，潜水艇和其他潜水器须在海面上航行并展示其旗帜。
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