广州地铁18号线的第三个遗憾是后通段一直没能竣工开通运营，线路没能接入广州东站，广州地铁18号线后通段长度只有3公里，只有一座车站广州东站，由于涉及广州东站国铁场升级改造，地铁18号线车站主体结构至今没能开工建设，导致地铁18号线无法接入广州东站这个重要铁路枢纽，无法跟地铁1号线、3号线、11号线换乘。 根据《2024年广州市交通发展年度报告》、《广州地铁2024年年报》，广州东站2024年日均发送铁路、城际的旅客量约为5.7万人次，地铁1号线、3号线2024年日均客运量更是高达83.43万人次、180.54万人次，这些庞大的客流量如果有一小部分汇入地铁18号线，其客流表现都不至于如此差劲。线路没有实现设计的换乘功能，也会显著影响地铁线网的整体运行效率，影响多条线路的通达性。
